lunes, 23 de marzo de 2015

Ya tenemos título: "Variations in the spontaneous mutation rate in a soil bacteria. Effect of gene location"

Hola a todos:
El final de trabajo se adivina; ¡lo tenemos al alcance de la mano!
Tras unos cuantos botones de calculadora, hemos podido determinar nuestras frecuencias de mutación para el gen SacB en los distintos aislados (distintas localizaciones):
3G: localizado a 11.764 nt del Origen de Replicación (ORI).
1F: localizado a  696.599 nt del ORI.
1H: cerca de regiones Ter, a 1.858.431 nt del ORI.



Como habéis visto esta mañana, de los datos podemos calcular la "mutation rate" (μ) para Sinorhizobium meliloti.   

Donde "f" ese la frecuencia de mutación encontrada y "N" es el número total de bacterias que dieron esa frecuencia. μ se calcula de forma iterativa (5 veces) dándole inicialmente el valor de f/5.

Tarea: calculad el valor de μ para cada aislado (localización). ¡El valor que nos de servirá para definir los márgenes de nuestro dato final el próximo viernes!

Nueva cita: Viernes a las 16:30.
Os dejo en recursos el trabajo de Drake (1991), por si os animáis a echarle un vistazo.



Aupa 2a Team!!!
¡¡¡Nos queda la guinda de un proyecto increíble!!!

Francisco Martínez-Abarca
Estación Experimental del Zaidín - CSIC
Departamento de Microbiología.

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