martes, 13 de enero de 2015

Nuestro primer resultado a la pregunta ¿dónde mutan (más) los genes?

En nuestra tercera sesión hemos empezado a descubrir que no estamos "simplemente" contando colonias, ¿verdad?

Empezamos a observar que los distintos fenotipos mostrados por las distintas bacterias (1H, 3G y la original RMO17) no son idénticos y que parecen tener una explicación. Empezamos a entender cómo se hacen los experimentos en Microbiología y qué tipo de respuestas dan. Por ejemplo: tiempos de generación, división celular, diluciones, conteos varios y test de sensibilidad/resistencia.
Por ahora, ya tenemos un primer resultado que deberemos de corroborar experimentalmente. Debemos pensar en repetir el experimento, añadir nuevos controles y comprobar si se confirma el patrón.

Pero... ¿de qué resultado estamos hablando?

En este esquema tenéis el procedimiento llevado a cabo para las diluciones seriadas.


De esta manera obtuvimos los siguientes datos para cada cultivo, os recuerdo.

Cultivo 3G: donde el gen SacB se encuentra arriba (cerca del origen de replicación).


Cultivo 1 H: donde el gen SacB se encuentra abajo (lejos del origen de replicación).



Estos datos nos llevan "de momento" a inferir la siguiente frecuencia de mutación para cada aislado:

Fmut3G: 96.3/(18.6 107) = 5,177 10-7
Fmut1H: 69.3/(7.85 106) = 8,88 10-6

Sin embargo hay varias razones que me inducen a pensar que debemos de confirmarlo:
  1. Necesitamos inferir márgenes de error. Todo experimento se recomienda repetirlo al menos 3 veces…
  2. Debemos de confirmar que los fenotipos son reales (cosa que ya estamos haciendo o no?)
  3. Hay además un resultado “extraño”. ¿Quien lo comenta?? ¡¡¡ES IMPORTANTE!!!
¡¡¡Aupa 2A Team!!!   ¡¡¡Ya estamos en la senda correcta!!!!
 
Francisco Martínez-Abarca
Departamento de Microbiología.
Estación Experimental del Zaidín. CSIC.
Granada

2 comentarios:

  1. Pista para el resultado extraño:
    La obtencion de los datos de resistentes a sacarosa para ambas cepas (3G y 1H) fue equivalente? o fue distinta? Recordad. Premio al que primero responda...

    Francisco Martínez-Abarca
    EEZ-CSIC

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  2. El resultado extraño consisitio en que las colonias derivadas de la 3G resistentes a sacarosa eran más pequeñas que las derivadas de 1H. De hecho, costó más obtener el número. Segun nuestro investigador, esto hace que debamos de repetir el experimento para confirmar este fenotipo.

    Equipo 2a.

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