sábado, 20 de diciembre de 2014

Nuestros primeros resultados

Hola a todos;
Tras la segunda sesión ya quedan atrás las primeras fantásticas impresiones... ¿o no? Sin embargo, ya empezamos a tener nuestros primeros resultados. Tras el conteo de colonias y la puesta en común de los datos observamos que ya podemos dar un valor a las bacterias presentes en una colonia. En caso de duda podéis consultar los correos anteriores.
Recapitulemos:
En vuestras libretas, tras el último día, debéis tener una tabla del conteo de las colonias de las placas semejante a esta que se incluye a continuación. Igualmente podéis acceder a imágenes de las placas a través de este enlace.


Esto nos ha permitido extrapolar los número de colonias contadas de manera que podamos estimar la cantidad de bacterias presentes en cada colonia como una media de, en algún caso, 4 valores.
Valores finales:
B:   14.7 x 106
A: 20,96 x 106
C: 6.015 x 106
D: 0.831 x 106
En otra ocasión hablaremos de los margenes de error y las desviaciones stándard. Entre vosotros ya hay gente familiarizada con estos parámetros estadísticos…
Debemos de recordar las operaciones que hicimos para obtener estos números. De nuevo, tenemos que calcular el número de generaciones que han transcurrido para la formación de cada una de las colonias; es decir,  ¿cuál es el numero de generaciones que han transcurrido para la colonia más grande y para la colonia más pequeña? Veréis como son bastante parecidos.
Y de estos valores surgen nuevas preguntas: ¿En cuántas generaciones ocuparían estas bacterias un volumen como el de la Tierra? ¿En cuánto tiempo? ¿Podríamos calcular de manera muy aproximada qué valor podríamos dar al volumen que ocupa una bacteria? ¿Ysu diámetro?
Premisas: Si imaginamos que cada colonia se corresponde con la mitad de una esfera cuyo diámetro en milímetros es el que aporta la tabla...¿En qué márgenes nos movemos en el calculo? Animémosnos, consultémoslo con nuestro entorno.Yo tan solo sé el valor que dicen los libros aceca del tamaño de S. meliloti, pero nunca he hecho este cálculo. En cualquier caso, soy todo oídos a posibles dudas o aclaraciones.

Por otro lado, nos esperan los resultados de un nuevo experimento (sobre el 9 de Enero o así). Hemos plaqueado dos cultivos (3G y 1H) partiendo de 1 x 108 bacterias por mililitro sobre placas conteniendo el antibiótico kanamicina (Km) y placas conteniendo Km y sacarosa al 10%. Las diluciones han sido distintas pues esperamos obtener un mayor numero de colonias totales (resistente a Km) que mutantes (resistentes a sacarosa). En paralelo hemos puesto placas con la bacteria parental (RMO17).
Pregunta: ¿Qué esperamos ver en las placas con sacarosa en relación a esta bacteria control? O en otras palabras, ¿esta bacteria será sensible o resistente a sacarosa? (Podéis encontrar algunas pistas en la presentacion del primer dia).
Y ya para terminar, Tanto Clara (no trajo sus placas) como Mario (no pudo venir) deben observar por una semana más las placas en casa y si se aprecian colonias como las que se ven en las imágenes de recursos del blog, deben de contarlas en las placas (-4 y -3) y darnos el dato al resto.
Atentos al wassap, el correo y el Blog (en este orden o en el inverso).
Un saludo y Feliz Navidad.

Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008 Granada. Spain


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3 comentarios:

  1. Anónimo12 de enero de 2015, 1:40

    1 Pregunta generaciones necesarias para ver una colonia?
    el numero de genraciones se extrapola de la formuala log(enbase2) del n de bacterias total.. Segun consensuado entre todos el dia 12.
    Bajo estos datos, nos salen los siguientes numeros:
    Colonia A ha sufrido 24,3 generaciones. Colonia B 23,8, C, 22,5 y D 19,67.
    Teniendo en cuenta que se han formado en tres dias, hemos calculado un tiempo de generacion medio de 2,96-3,70-
    Que listos somos!!!!

    Equipo 2a!!

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  2. Víctor Fernández Trespando18 de enero de 2015, 13:33

    Para calcular el número de generaciones necesarias para ocupar el volumen de la Tierra y el volumen de cada bacteria he tomado la colonia B (diametro: 1,4mm; nº de bacterias: 147x10^6). He calculado el volumen de la colonia y me ha dado 0,71mm3. Este resultado lo he dividido entre el nº de bacterias para saber el volumen de una bacteria: 4,88x10^-27 km3, de manera que para ocupar el volumen de la Tierra (1,08x10^12 km3) se necesitan 2,21x10^38 bacterias. Despues aplicamos la fórmula general para obtener el número de generaciones (log2^nº de bacterias) nos da 127,37 generaciones para ocupar el volumen de la Tierra. Sabiendo que el tiempo medio que tarda en crecer una generacion es 3,33h podemos calcular que tardarian en completar el volumen de la Tierra 424.1421 horas.

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  3. Anónimo21 de enero de 2015, 2:57

    Hola Victor: buen calculo salvo por el lio de las comas (,) y los puntos(.). Entiendo que el valor final en horas, el punto indica el comienzo de decimales, esto es: 424,1421 h, que dividido por 24h/dia, nos sale que a esa velocidad de division S meliloti tardaria tan solo 17,67 dias en llenar todo ese volumen. Otra cosa es lo que comeria para mantener esa velocidad ¿no?.
    Todavia menos tiempo tardaria en cubrir la superficie de la tierra no?. Quien se anima??
    Pista: (ahora lo que importa es la superficie ocupada por una bacteria; el area, no el volumen¿?).

    Dr Francisco Martinez-Abarca
    EEZ-CSIC

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